Absolventi studijního programu získávají odbornou způsobilost k výkonu povolání nebo k pokračování v navazujícím vysokoškolském studiu. Zaměření studia je na získání adekvátních odborných znalostí z oblasti fylogene, taxonomického postavení, ekologie a ochrany organismů. Absolvent také získá základní znalosti z dalších biologických disciplín, jako je antropologie, genetika, molekulární biologie, fyziologie rostlin a živočichů, evoluční biologie, což doplňuje jeho odborný profil. Získají adekvátní přehled o biodiverzitě a její ochraně, evolučním vývoji organismů i ekologických procesech působících na různých úrovních života. Jsou schopni se orientovat ve světovém systematickém postavení fauny a flóry, mají přehled o informačních zdrojích k této problematice a s jejich pomocí jsou schopni identifikovat na požadované úrovni druhy fauny a flóry Slovenska, případně jiných biogeografických oblastí. Mají základní znalosti o našich i mezinárodních legislativních normách nezbytných pro práci v oblasti ochrany přírody. Ovládají metody studia a zpracování živých přírodních materiálů (zejména pro potřeby identifikace a základní konzervace), metody sběru biologického materiálu v terénu, odběr vzorků, dokumentaci fauny a flóry, laboratorní zpracování biologického materiálu a rekonstrukce fylogenetických vztahů. Vzhledem k zastoupení některých předmětů experimentálních biologických disciplín ve studijním plánu (genetika, molekulární biologie a jejich metody) má absolvent také přehled o laboratorních postupech používaných při studiu genetické diverzity organismů. Po ukončení studia je schopen spolupracovat v profesionálním týmu při řešení vědeckých problémů a jejich uvádění do praxe.

Převážná většina absolventů bakalářského programu Systematická biologie pokračuje v magisterském nebo doktorském studiu v programech zoologie, botanika a biologie (zaměření ekologie). Jejich následné úspěšné uplatnění v praxi je tedy výsledkem celého studia, nejen bakalářského studia.
Absolventi studijního programu Systematická biologie se mohou uplatnit ve státní správě, veřejné správě, vědeckých institucích a nevládních organizacích, např. Slovenská akademie věd, Státní ochrana přírody Slovenské republiky, Výzkumný ústav vodohospodářský, Ministerstvo životního prostředí, Ministerstvo zemědělství, Státní veterinární a potravinářská správa, Slovenský hydrometeorologický ústav, Slovenské národní muzeum - Přírodovědné muzeum a další přírodovědná muzea na Slovensku, Bratislavské regionální ochranné sdružení (BROZ), Slovenská ornitologická společnost/BirdLife Slovakia, Daphne - Ústav aplikované ekologie, ochrany dravců a sov Slovensko a další nevládní organizace se zaměřily na ochranu přírody. Mnoho absolventů také zakládá vlastní firmu, pracuje jako nezávislí odborníci v oblasti monitorování bioty a podílejí se na posuzování vlivů na životní prostředí (EIA).