Specialista biologů – mikrobiologie a virologie disponuje širokým spektrem znalostí ze všech oblastí biologických věd, chemických věd a v rámci širšího vědeckého základu také z matematiky, fyziky a hraničních vědních disciplín. Ovládají speciální metody vybraných vědních disciplín a jejich aplikaci do různých oblastí biologického výzkumu, mají důkladnou znalost struktury a vlastností živých systémů, umí modelovat biologické procesy a prakticky využívat znalosti v různých oblastech společenské praxe. Absolventi oboru mikrobiologie a virologie (2. stupně) mají znalosti vybraných úžeji zaměřených biologických věd, jako jsou: virologie, molekulární biologie, imunologie, mikrobiologie, biotechnologie, mají znalosti z několika hraničních vědních disciplín a mohou je využít při řešení praktických úkolů.

Absolvent získá praktické schopnosti a dovednosti, zejména
používat a rozvíjet metody virologických, mikrobiologických, biochemických a molekulárně-biologických disciplín;
- práce s vybavením a materiálem používaným v základním a aplikovaném virologickém, mikrobiologickém a molekulárně-biologickém výzkumu;
- analyzovat data získaná v experimentálním výzkumu
- na základě získaných dat a s využitím domácí i zahraniční odborné literatury navrhnout možné řešení problému.

Absolventi oboru mikrobiologie-virologie se mohou uplatnit na širokém spektru pracovišť s mikrobiologickým, virologickým, molekulárně-biologickým a imunologickým zaměřením ve výzkumných týmech i v samostatné práci s výzkumným a technickým zaměřením (SAS, vysoké školy, ministerstva zdravotnictví, veterinárního lékařství, zemědělství a lesnictví, potravinářství, životního prostředí apod.). Absolventi oboru mikrobiologie a virologie Přírodovědecké fakulty Univerzity Komenského v magisterském studiu ovládají základní vědecké metody mikrobiologického, virologického a molekulárně-biologického výzkumu, které jsou schopni tvůrčím způsobem aplikovat ve své práci a přispívat tak k rozvoji vědeckého poznání. Mají předpoklady pro úspěšnou týmovou práci v širokém spektru vědeckých a výzkumných institucí zaměřených na environmentální, lékařské, veterinární nebo farmaceutické vědy, jsou odborně připravováni pro tvůrčí práci ve vědeckých ústavech Slovenské akademie věd, na různých úrovních výzkumu a řízení environmentálních, zemědělských, potravinářských či zdravotnických pracovišť, dále na vysokých školách a v institucích ochrany přírody.

Absolventi nacházejí uplatnění také na všech vysokých školách s přírodovědným, pedagogickým a lékařským zaměřením, ale také ve speciálním výzkumu Ministerstva vnitra Slovenské republiky. Absolventi se mohou uplatnit také na pracovištích ministerstev zdravotnictví (diagnostické laboratoře, molekulárně-biologické, biochemické). Absolventi oboru mikrobiologie a virologie Přírodovědecké fakulty Univerzity Komenského se vyznačují vysokou úspěšností při získávání doktorských stipendií ve špičkových domácích i zahraničních vědecko-výzkumných institucích veřejného i soukromého sektoru a mají také vynikající perspektivu uplatnění v malých a středních podnicích zaměřených na aplikovaný, ale i základní výzkum v oblasti biotechnologie, genetiky, mikrobiologie, molekulární biologie a virologie.