Absolventi magisterského studijního programu Analytická chemie ovládají metody vědecké práce a vědeckého poznávání, aplikují etické principy ve vědě a principy zelené analytické chemie v praxi. Umí charakterizovat principy anorganické, organické, fyzikální chemie a biochemie a popsat obecné i specifické oblasti analytické chemie (stopová a ultrastopová analýza a analýza komplexních vícesložkových vzorků, analýza chirálních látek), aplikačně orientované oblasti (environmentální a farmaceutická analýza a analýza klinických a biologických vzorků) a metodicky orientované oblasti (identifikační a detekční metody, separační metody, chemometrické metody a metody úpravy vzorky). Znají zásady správné laboratorní praxe, zásady BOZP, hygienu práce a požární ochranu, postupy pro nakládání s toxickými a nebezpečnými látkami, zásady správné laboratorní praxe a legislativu související s analytickou chemií (normy a předpisy státních a evropských orgánů). Absolvent může posoudit a vyhodnotit výchozí suroviny, ověřit lékopisné a validované metody a provádět obecné pracovní operace v chemicko-fyzikální laboratoři. Na základě analýzy vstupních dat výzkumných a vývojových úkolů je schopen navrhnout efektivní postupy odběru vzorků a relevantních fyzikálně-chemických zkoušek, aplikovat analytické metody, identifikovat příčiny chybných výsledků rutinních analýz a ověřit výsledky řešení výzkumných a vývojových úkolů. Na základě získaných poznatků je schopen nacházet řešení a přijímat odpovědnost za výsledky své analytické činnosti.

Absolventi magisterského studijního programu Analytická chemie jsou schopni aplikovat získané znalosti a praktické dovednosti samostatně nebo jako členové týmu, neustále rozvíjet svůj odborný růst, udržovat kontakt s rozvojem analytické chemie a příbuzných vědních disciplín doma i v zahraničí a komunikovat s odbornou veřejností. Drtivá většina absolventů pracuje v oborech souvisejících s analytickou chemií, v laboratořích kontroly kvality farmaceutických výrobků, potravin, vody a vodních toků a v obecné kontrole složek životního prostředí. Někteří absolventi našli uplatnění ve firmách obchodujících s analytickými přístroji, přístroji a chemikáliemi, ale také ve vzdělávacích institucích, kde pracují jako odborníci v oblasti analytické chemie v rámci národních i mezinárodních projektů. Absolventi se také uplatní ve vedení projektů a odborných skupin, např. v laboratořích kontroly kvality a kontroly výrobních procesů (státní zdravotní ústavy, laboratoře celní kontroly, laboratoře vodáren a kanalizací, forenzní laboratoře, klinické laboratoře, provozní laboratoře, vysoké školy a univerzity). Na těchto pracovištích jsou také schopni vykonávat samostatnou rutinní laboratorní práci, kde aktivně využívají znalosti, zkušenosti a dovednosti získané během studia, např. v oblasti separačních, identifikačních, spektrálních a optických metod a elektrochemických metod chemické analýzy. Absolventi studijního programu jsou v praxi zaměstnáni jako pracovníci schopní kriticky vyhodnocovat získané informace a pracovní úkoly, mohou aplikovat vhodný přístup k řešení zadaných pracovních problémů a korigovat svou odbornou a rutinní pracovní činnost intenzivnější zpětnou vazbou tak, aby nedocházelo k nesprávné interpretaci výsledků jejich reflexí a analytických měření. Absolventi mají zkušenosti s pochopením pracovních úkolů a činností, formulací pracovních hypotéz, návrhem a plánováním experimentů pomocí prostředků sebekontroly různými typy testů, ověřováním hypotéz a analýzou získaných dat.