Fyzikální chemik je schopen vykonávat nebo řídit vysoce odbornou vědeckou, tvůrčí činnost ve výzkumu, poskytuje poradenství nebo vzdělávání v oblasti fyzikální chemie a v dalších oblastech chemie a příbuzných oborech. Absolvent je schopen používat teoretické modely chemie a fyziky, spektrální, optické, elektrochemické a další metody. Jsou schopni aplikovat získané teoretické znalosti a praktické dovednosti v různých oblastech výrobních a technologických procesů i ve výzkumné sféře. Po ukončení studia je schopen dále rozvíjet znalosti ve vývoji oboru, formulovat problémy a hypotézy, určovat vhodné postupy a techniky pro řešení vědeckého nebo odborného problému, samostatně nebo s vedeným týmem, interpretovat, aplikovat, prezentovat a publikovat výsledky výzkumu. Jsou schopni realizovat aplikace výsledků výzkumu v jiných vědních oborech v ekonomické praxi. Je tvůrčím pracovníkem nejen ve výzkumu, technologické praxi, ale i v různých oblastech aplikace fyzikální chemie a příbuzných vědních oborů.
Absolventi magisterského programu Fyzikální chemie nacházejí uplatnění na různých pozicích vědecko-výzkumného, chemického a technologického průmyslu všude tam, kde se uplatňuje aktivní využití znalostí základních fyzikálně-chemických principů a metod. Příkladem jsou výzkumné a vývojové pozice v chemických laboratořích, ústavech Slovenské akademie věd, vysokých školách a univerzitách zaměřených na výzkum v oblasti chemie a fyziky. Další uplatnění ve firmách zaměřených na chemii, průmyslovou a farmaceutickou chemii, v národních referenčních centrech a laboratořích, kde je vyžadováno chemické vzdělání. Očekává se, že bude využíván v nových spin-offech a malých soukromých firmách zaměřených na nové technologie, metody a materiály, včetně nanotechnologií a nanomateriálů.
Absolventi oboru Fyzikální chemie nacházejí uplatnění v širokém spektru pracovišť s chemickým, technologickým, vědeckým a výzkumným zaměřením, vývojovým zaměřením ve výzkumných týmech i v samostatné práci s výzkumným a technickým zaměřením (SAS, vysoké školy, resorty školství, zdravotnictví, průmysl, vývoj, zemědělství, materiálový výzkum, farmacie, potravinářství, životní prostředí atd.). Absolventi programu Fyzikální chemie Přírodovědecké fakulty Univerzity Komenského na magisterském stupni ovládají základní vědecké metody výzkumu v oblasti fyzikální chemie a příbuzných oborů, které jsou schopni tvůrčím způsobem aplikovat ve své práci a přispívat tak k rozvoji vědeckého poznání. Mají předpoklady pro úspěšnou týmovou práci v širokém spektru vědeckých a výzkumných institucí zaměřených na chemické, fyzikálně-chemické, materiálové, farmaceutické a biofyzikální vědy a vědní obory. Jsou odborně vyškoleni pro tvůrčí práci ve vědeckých ústavech SAVS a vysokých školách, na různých úrovních výzkumu, vývoje a řízení oddělení techniky a průmyslu, životního prostředí, zemědělství, potravinářství a ochrany přírody.
Absolventi nacházejí uplatnění také na všech vysokých školách s přírodovědným, pedagogickým a technologickým zaměřením, ale také ve speciálním výzkumu jiných slovenských ministerstev. Absolventi se mohou uplatnit i na speciálních pozicích na pracovištích zdravotnických a potravinářských oborů (nové fyzikálně-chemické diagnostické laboratoře). Absolventi programu Fyzikální chemie Přírodovědecké fakulty Univerzity Komenského se vyznačují vysokou úspěšností při získávání pozic na Slovensku, ale i v zahraničí, získáváním doktorských stipendií ve špičkových domácích i zahraničních vědeckovýzkumných institucích veřejného i soukromého sektoru a mají také výborné uplatnění v malých a středních podnicích zaměřených na aplikovaný výzkum v oblasti chemie, ale i základního výzkumu, technologie, vývoj a implementace vědeckých poznatků v nových podnicích a výzkumných firmách.