Absolventi doktorského studia jsou připraveni pro samostatnou tvůrčí vědecko-výzkumnou činnost v oblasti organické, bioorganické a materiálové chemie v oblasti výzkumu nejen v akademické, ale i v technologické praxi. Ovládá základní principy i nejmodernější poznatky v oblasti organické syntézy, bioorganické a medicinální chemie, fyzikální organické chemie, rozumí vztahům mezi strukturou organických sloučenin a jejich reaktivitou, zná mechanismy organických reakcí a pomocí pokročilých spektroskopických metod dokáže určit strukturu organických sloučenin. Používají moderní metody separace vícesložkových směsí organických látek, izolace organické hmoty z přírodních zdrojů a čištění produktů. Absolventi ovládají výzkumné a vývojové metody používané v moderních laboratořích organické chemie. Mohou samostatně navrhovat vícestupňové syntézy organických sloučenin, včetně stereoselektivních syntéz, s využitím nejmodernějších poznatků v oblasti asymetrické katalýzy a netradičních aktivačních metod, jako je mikrovlnné záření, ultrazvukové vlny, mechanická aktivace v kulovém mlýně, fotochemie. Navrhují nové syntetické procesy v souladu s požadavky zelené chemie a udržitelného rozvoje. Umí pracovat s chemickým softwarem a chemickými databázemi a při experimentální práci využívají znalosti výpočetních metod a molekulárního modelování.
Absolventi doktorského studia jsou schopni samostatně vést výzkumné skupiny složené z absolventů magisterského a bakalářského studia a technických pracovníků. Nezávisle formulují, interpretují, prezentují a publikují výsledky výzkumu. Mohou se podílet na výuce odborných předmětů na vysokých školách. Za účelem získání finančních prostředků na svůj výzkum jsou schopni vypracovat kvalitní návrhy projektů. Absolventi studijního programu Organická chemie mají všechny předpoklady pro uplatnění v mnoha příbuzných oborech vědeckého výzkumu, jako je lékařská chemie, farmaceutická chemie, materiálová chemie, chemie životního prostředí a biochemie.
Absolventi studijního programu nacházejí uplatnění na všech vysokých školách, kde se vyučují chemické a materiálové vědy. Díky seznámení se s širokým spektrem poskytovaných poznatků se absolvent uplatní na pracovištích Ministerstva zdravotnictví, kultury, sportu, ale i v institucích využívajících znalosti vztahu člověka a pracovního prostředí (průmyslový design, pracovní lékařství, architektura a technologie), ve státních institucích zabývajících se ochranou přírody a životního prostředí (Státní ochrana přírody Slovenské republiky, Slovenská inspekce životního prostředí, Slovenská agentura životního prostředí, příslušná ministerstva a úřady), ústavy Ministerstva životního prostředí a zemědělství (např. Výzkumný ústav vodohospodářský, SHMÚ), soukromé společnosti provádějící chemické, biologické a ekologické průzkumy, posuzování vlivů na životní prostředí nebo ve speciálním výzkumu Ministerstva vnitra Slovenské republiky.
Absolventi doktorského studia organické chemie se uplatní jako vysokoškolští učitelé nebo výzkumní pracovníci na přírodovědných univerzitách, dalších vzdělávacích a výzkumných institucích, včetně ústavů akademií věd (Ústav chemie SAV, Ústav polymerů SAV, Biomedicínské centrum SAV. Zaměření umožňuje absolventům uplatnění jako kontroloři a odborníci také ve státních, resortních výzkumných, zkušebních a kontrolních ústavech, jakož i na ministerstvu životního prostředí a okresních úřadech životního prostředí. V soukromém sektoru se mohou uplatnit jako výzkum, vývoj a specialisté ve farmaceutickém a chemickém průmyslu, v zemědělství i v biotechnologických soukromých společnostech – např. výroba biopaliv a biologicky aktivních látek, dekontaminace oblastí postižených znečišťujícími látkami, zpracování chemických odpadů a bioodpadu.
Seznam profesí, na které je absolvent nejvíce připraven v době absolvování SP Organická chemie: ISCO-08 https://www.kvalifikacie.sk/sites/nsk/files/employers/sk_isco-08_0.pdf
• 1321008 manažer v chemické výrobě• 2113005 organický chemik
• 2310004 univerzitní asistent• 1223001 řídící pracovník výzkumné instituce
• 2145002 výzkumný chemický specialista a Rozvoj