Cílem výuky v rámci studijního programu Inženýrská geologie a hydrogeologie je zprostředkovat studentům pokrok ve vědě v oblasti výzkumu příčin, vzájemné interakce lidské činnosti s geologickým prostředím a jejími důsledky, ukázat jim všechny aspekty teorie, principů, metodologie a praxe a naučit je samostatné inženýrsko-geologické nebo hydrogeologické vědecké činnosti.
Absolventi třetího stupně vysokoškolského vzdělání v oboru inženýrská geologie a hydrogeologie ovládají vědecké metody výzkumu v inženýrské geologii a hydrogeologii. V rámci studia se může specializovat na inženýrskou geologii nebo hydrogeologii. Předměty a samostatné studium ve specializaci Inženýrská geologie jsou orientovány na moderní metody racionálního využívání geologického prostředí s důrazem na prevenci geologických rizik a minimalizaci geologických rizik, na moderní technologie průzkumných prací, předprojektovou a projektovou přípravu staveb a jejich realizaci, technologie sanace stavebních vad, a to i v kontextu ochrany kulturního dědictví, netradiční stavební materiály, moderní technologie zušlechťování hornin životní prostředí a jeho ochrana před znečištěním. Předměty a samostatné studium ve specializaci hydrogeologie jsou zaměřeny na vyhledávání, prognózování vývoje, projektování využití a ochrany veličin a jakosti podzemních vod, na problematiku interakce podzemních vod s horninovým prostředím, jakož i mezi podzemními vodami a technickými pracemi, na hydrogeochemické hodnocení a ochranu podzemních vod, na řešení antropogenních vlivů na podzemní vody a na možnosti jejich ochrany, stejně jako otázka racionálního využívání minerálních a geotermálních vod.
Absolvent je schopen navrhovat a aplikovat nové metody a postupy při řešení problémů v souladu se světovými trendy a poznatky. Získané poznatky jsou zpracovány a prezentovány pomocí moderních technologií. Hlavní témata jádra poznání mu poskytují teoretický a metodologický aparát umožňující vědecký výzkum, formulaci vlastních metodologických postupů pro řešení výzkumných a vědeckých problémů, jejich tvůrčí aplikaci v praxi, tvorbu informačních systémů a aplikačních databází. Jsou schopni navrhovat metody zpracování dat a prezentovat výsledky své vědecko-výzkumné činnosti na domácích i mezinárodních fórech ve vědeckých i odborných kruzích, popularizovat a přibližovat obor studia a výsledky výzkumu široké veřejnosti. Při navrhování metod a postupů si je vědom etických, právních a environmentálních aspektů navrhovaného způsobu řešení problému a aplikuje je v souladu s principy udržitelného rozvoje. Uplatňuje principy vědecké práce a závaznosti: výzkum – průzkum – využití v praxi – ochrana.
Absolventi třetího stupně vysokoškolského vzdělání ve studijním programu Inženýrská geologie a hydrogeologie ovládají aplikace geologie při řešení problémů racionálního využívání geologického prostředí, předprojektové a projektové přípravy staveb, jejich zakládání, výstavby a využívání. Zná technologie průzkumných prací a zlepšování skalního prostředí. Získali pokročilé a pokročilé znalosti v oblasti hydrogeologie, jsou schopni řešit úkoly hydrogeologického výzkumu a průzkumu obyčejných, minerálních a geotermálních vod, mohou řešit problémy znečištění a ochrany podzemních vod, jakož i sanace ekologických zátěží. Ovládají zpracování kvantitativních dat o geologickém prostředí do databází a jejich využití matematickými metodami a matematickým modelováním. Tyto dovednosti jsou nezbytné pro teoretickou připravenost doktoranda z hlediska jeho znalostí, ale také podporují rozvoj jeho potenciálu v široké oblasti inženýrsko-geologické a hydrogeologické praxe. Výsledky vzdělávání se promítnou i do přehledu studenta na úrovni metodologických přístupů k učivu.