Doktorský studijní program Meteorologie a klimatologie navazuje na magisterské studijní programy v oboru Fyzika. V některých případech je možné do studijního programu Meteorologie a klimatologie přijmout i absolventy jiných magisterských studijních programů, pokud se jedná o uchazeče s dobrou znalostí meteorologie a klimatologie a s potřebnými znalostmi fyziky a matematiky, které lze ověřit osobním pohovorem a speciální zkouškou před komisí. Je možné přijmout 1 až 4 studenty na plný úvazek a 1-4 studenty na částečný úvazek na jeden rok. Studijní program Meteorologie a klimatologie je zaměřen na přípravu absolventů pro náročnou vědeckou a praktickou činnost v daných oborech. Uplatnění najdou zejména ve Slovenském hydrometeorologickém ústavu, na Matematicko-fyzikální fakultě Univerzity Komenského, v ústavech Slovenské akademie věd a v dalších obdobných institucích na Slovensku i v zahraničí. Užší zaměření absolventů je orientováno do několika oblastí, které lze rozdělit do pěti skupin:

1. Předpověď;
2. Klimatologie;
3. Modelování v meteorologii a klimatologii;
4. Ochrana životního prostředí;
5. Aplikace meteorologie a klimatologie v dalších oborech (vodní hospodářství, zemědělství, lesnictví atd.).

Studijní program je rozdělen na Studijní část 1 (povinná), Studijní část 2 (povinně nepovinná), Vědecká část (povinně volitelná) a Pedagogická část (nepovinná).

Studium část 1 

• Fyzika klimatického systému Země
• Samostatné studium vědecké a odborné literatury
• Vybrané kapitoly z dynamické meteorologie
• Samostatné studium vědecké a odborné literatury

Studium část 2 

• Objekty synoptické analýzy a prognózy vybraných charakteristik stavu atmosféry
• Regionální klimatologie
• Fyzika mezní vrstvy atmosféry
• Změna klimatu, její příčiny a důsledky
• Předpověď počasí pomocí numerických modelů počasí
• Chemie atmosféry